Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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