Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ccdc39Q9D5Y1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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