Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sf3a3Q9D554 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3a3Q9D554 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms