Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms