Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcc1Q9D4H2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gcc1Q9D4H2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms