Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UvssaQ9D479 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UvssaQ9D479 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms