Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4933428M09RikQ9D3X3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms