Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pus10Q9D3U0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms