Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim42Q9D2H5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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