Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcas2Q9D287 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcas2Q9D287 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Bcas2Q9D287 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bcas2Q9D287 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Bcas2Q9D287 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bcas2Q9D287 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas2Q9D287 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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