Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syf2Q9D198 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syf2Q9D198 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms