Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpsap1Q9D0M1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prpsap1Q9D0M1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms