Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mdm1Q9D067 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mdm1Q9D067 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms