Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc47Q9D024 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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