Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Utp11Q9CZJ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms