Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl55Q9CZ83 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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