Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ChtopQ9CY57 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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