Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mis12Q9CY25 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mis12Q9CY25 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms