Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exo5Q9CXP9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Exo5Q9CXP9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exo5Q9CXP9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms