Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpusd4Q9CWX4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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