Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxxc1Q9CWW7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxxc1Q9CWW7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms