Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ddx28Q9CWT6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ddx28Q9CWT6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ddx28Q9CWT6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ddx28Q9CWT6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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