Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms