Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otud1Q9CUB6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Otud1Q9CUB6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms