Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim8Q9CQQ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms