Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms