Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl35Q9CQL6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl35Q9CQL6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl35Q9CQL6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Mrpl35Q9CQL6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl35Q9CQL6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Mrpl35Q9CQL6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl35Q9CQL6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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