Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms