Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms