Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CQC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms