Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ClpsQ9CQC2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClpsQ9CQC2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms