Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms