Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sike1Q9CPR7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sike1Q9CPR7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms