Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl17Q9CPR4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl17Q9CPR4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms