Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
4930550L24RikQ99PA7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms