Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tsnaxip1Q99P25 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms