Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b1Q99NB9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b1Q99NB9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms