Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Ubqln4Q99NB8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubqln4Q99NB8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ubqln4Q99NB8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubqln4Q99NB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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