Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atoh8Q99NA2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atoh8Q99NA2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms