Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac9Q99N13 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac9Q99N13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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