Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp1b4Q99ME6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms