Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cstf3Q99LI7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms