Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf2Q99LE6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms