Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms