Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf34Q99KR6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms