Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Reep3Q99KK1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms