Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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TrabdQ99JY4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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TrabdQ99JY4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TrabdQ99JY4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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