Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdelr1Q99JH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms