Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnip2Q99JG7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms