Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pacsin3Q99JB8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms